熒光定量PCR的檢測離不開熒光定量PCR試劑和
qPCR熒光定量PCR儀,儀器由熒光定量系統(tǒng)和計算機(jī)組成,用來監(jiān)測循環(huán)過程的熒光。與實時設(shè)備相連的計算機(jī)收集熒光數(shù)據(jù)。
對于熒光定量PCR儀的評價,相信大家一定是不知道的。熒光定量PCR儀涉及很多溫度、光電信號等,專業(yè)性評估,還有就是不知道從哪里入手。今天我們梳理下在核酸檢測實驗室中如何通過試驗來評價熒光定量PCR儀。
qPCR熒光定量PCR儀的試驗設(shè)計:
一、試驗準(zhǔn)備
1、有證標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì):國內(nèi)外有證標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)類型為質(zhì)粒DNA或RNA。不推薦使用自制沒有進(jìn)行定量的質(zhì)控品。
2、熒光染料:可以選用試劑盒自帶的ROX染料或購買標(biāo)準(zhǔn)熒光染料。
3、熒光定量PCR方法:需要使用經(jīng)過驗證過的熒光定量方法,擴(kuò)增效率90%-110%(越接近100%越好);R2大于0.99;檢測限應(yīng)低于10copies/反應(yīng)。
4、反應(yīng)體系:質(zhì)量高口碑好的反應(yīng)體系。
5、耗材:儀器推薦使用的專用于熒光定量PCR的耗材。
6、反應(yīng)條件:常規(guī)熒光定量PCR反應(yīng)條件,普通模式,40個循環(huán)。不建議使用快速模式和預(yù)擴(kuò)增反應(yīng)條件。
二、重復(fù)性試驗
選擇高中低濃度標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)進(jìn)行檢測(推薦濃度為5000copies/反應(yīng)、500copies/反應(yīng)和50copies/反應(yīng)),每個濃度至少5次重復(fù),樣品管隨機(jī)放置在反應(yīng)板中心和邊緣的不同位置。Ct值變異系數(shù)不大于3%。
如果qPCR熒光定量PCR儀檢測中使用雙重或多重?zé)晒鈾z測,可設(shè)計如用FAM探針擴(kuò)增用VIC通道檢測,檢測結(jié)果不應(yīng)該有高于閾值線的熒光信號。